BrainyCP

Использую на сайте довольно мощную программу, которой в работе требуется PHP CLI
В программе даже есть Диагностика для проверки работоспособности PHP CLI. Благодаря ей и имею возможность достаточно подробно расписать проблему.
1. Не определяется путь к PHP CLI, надо вписывать в ручную, но и сам не могу ее найти. Программа использует /usr/bin/php хотя таковой не существует (я ее не вижу)
2. На PHP 7.1 не определяется один параметр
mysql fpm-fcgi , cli выключено
на PHP 5.6 это уже выглядит так
mysql fpm-fcgi включено, cli выключено
а должно быть так
mysql fpm-fcgi включено , cli включено
3. Проверка PHP CLI и фоновых задач
на PHP 7.1 выдает Проблем нет
а на PHP 5.6 выдает о При запуске теста произошла неизвестная ошибка, попробуйте проверить права доступа
4. При удалении PHP 5.6 разрушается PHP CLI и для PHP 7.1 если ранее были установлены оба PHP.

При переносе сайта на панель Веста, все работает корректно!
Почему на Брейни такие проблемы и как их решить?

Посмотрите какой у вас пхп установлен по умолчанию и сделайте на него символическую ссылку. Например для пхп 7.1

ln -sf /usr/bin/php71/bin/php /usr/bin/php

Для PHP 7.1 не произошло никаких изменений
Все так же
mysql fpm-fcgi , cli выключено

посмотрите в самом скрипте чего он пытается искать и где

Скрипт закублен! Разработчик посмотрел на ситуацию и сообщил, что в принципе ничего серьезного, можно работать.

НО!!! Если вы помните, с самого начала писалось, что на РНР 5.6 уже не все так радужно!